Es el protagonista de Evangelion y piloto del EVA 01. Es hijo del comandante de NERV (Gendo Ikari) y de Yui Ikari. Es un personaje muy tímido, cerrado y autosuficiente. Al principio no tiene amigos, pero a medida que pasa la serie su personalidad evoluciona hasta ser mas sociable y amigable.

Luego de que murió su madre, Gendo lo abandonó y Shinji vivió su infancia con sus abuelos. Cuando diez años después vuelve a ver a su padre como comandante de NERV, la relación no es la mejor (si es que existe una). Vive deprimido y-muchas veces lo ha manifestado-, sin ganas de vivir. Sin embargo, a lo largo de la serie evoluciona de tal forma que llega hasta a rebelarse a NERV y su padre.

Asuka es de origen germano - nipón - americano y pilota el EVA 02, de lo cual se siente orgullosa. Siempre intenta comportarse como una adulta por culpa de su pasado. Su madre (Kyoko Zeppelin) enloqueció luego de un accidente en una prueba del EVA 02 y confundía a Asuka con una muñeca. Entonces su padre se divorció de ella y se casó, llevandose a Asuka.

Hay que destacar de ella sus estudios, en lo que sobresale notablemente. Con solo 14 años se graduó en la universidad, pero fue seleccionada por el instituto Marduk para pilotar el EVA 02. Hecho que llevó a Kyoko Zeppelin a suicidarse.

Le gusta ir al frente y sobresalir en las operaciones de NERV, y le gusta Kaji.

Es el personaje mas frío de toda la serie. Pilota el EVA 00 y, como ella dice (las pocas veces que habla) nació solo para ello. Sin el EVA, no tendría nada.

Su pasado es muy misterioso, sin embargo sabemos que Gendo la quiere tanto porque Rei es resultado del ADN de su esposa (Yui Ikari) y de Lilith, el segundo angel. Tuvo muchos problemas para sincronizarse con el EVA 00, y esto no es nada raro sabiendo que dentro de esa unidad está el alma de Naoko Akagi, una antigua operadora de NERV, creadora del sistema MAGI, que estaba enamorada de Gendo. A lo largo de la serie vemos como Rei se va superando y haciendo más sociable de lo que era en un principio. Incluso se sacrificará por salvar a Shinji. A partir de ese entonces aparece la tercera Rei, ya que la primera murió ahorcada por la dra. Naoko Akagi (madre de Ritsuko) y la segunda murió como ya dije anteriormente.

Misato Katsuragi tiene 29 años. Trabaja en NERV primero como capitana, y luego como comandante de tácticas y operaciones.

Cuando era chica, viajó con su padre a la antártida, en la llamada "Operación Katsuragi", para examinar un cuerpo que había caído del espacio en la Antártida. Cuando llegan se dieron cuenta que se trataba de un tipo de vida extraterrestre y, cuando intentaban despertarlo, provocaron la mayor catástrofe en la historia de la humanidad: el cataclismo conocido como el Second Impact. Misato fue la única sobreviviente gracias a su padre, que la colocó en una cápsula de escape justo antes de la explosión.

Luego de este accidente, Misato estuvo dos años sin hablar, traumada por ese episodio. Pero luego se repone. A partir de entonces, comenzó a ser otra persona: alegre, vivaz, y muy habladora. Aunque por dentro seguía dolida. Entablaría amistad con Ritsuko Akagi en la universidad, y un noviazgo con Ryoji Kaji.

Ya en el 2014 y en NERV, los tres se reencuentran. Y misato irá mostrando, poco a poco, su verdadera actitud seria.

Gendo Rokubungi nació en 1967 y tiene 48 años. Es el comandante de NERV. Realizó sus estudios en la universidad de Kyoto, donde conoció a Yui Ikari y a Kozo Fuyutsuki, su profesor. Al casarse con Yui, se cambia su apellido a Ikari, ya que la familia de ella era más rica que la suya. Comienza a planear junto con su esposa una serie de proyectos que les ocuparán toda su vida, entre ellos el Proyecto E y el Plan para la Complementación Humana, cosiderando este último el más importante. El se salvó de la catastrófica "Operación Katsuragi" ya que abandonó el barco que los llevaría un día antes. Hecho que lleva a desconfiar, conociendo lo frío y calculador que es, que sabía el futuro de esa misión. En el 2001 nace su primogénito Shinji Ikari, a quién abandona a los 4 años al morir su esposa.

Ya en el 2010, con NERV bajo su mando, se reencuentra con Shinji.